1918年，阮啸仙考入广东省立第一甲种工业学校。在校期间，他开始阅读《新青年》等进步书刊，逐步接受马克思主义。五四爱国运动爆发后，他与一批进步青年学生组织了广东中等以上学校学生联合会，担任执行委员，参与领导广州地区的学生运动。

1921年春，阮啸仙参加广州党的早期组织。1922年毕业后，受广东党组织委派，他负责筹备成立社会主义青年团两广区委员会的工作，被选为团区委书记，成为广东社会主义青年团的领导人。

1923年6月，阮啸仙在广州组织团的外围组织——新学生社，担任该社执行委员会书记。1923年8月，在中国社会主义青年团第二次全国代表大会上，阮啸仙被选为团中央执行委员会候补委员。

第一次国共合作实现后，阮啸仙先后担任中共广东区委农民运动委员会书记、国民党中央农民部组织干事、广东省农民协会执行委员会常务委员、中共中央农民运动委员会委员、中共广东省委委员和农民运动委员会书记，是大革命时期农民运动的重要领导者之一。

1927年4月27日，党的五大在武汉举行，阮啸仙被选为中央监察委员会候补委员。

1928年1月，中共仁化县委成立，阮啸仙任县委书记，领导发动仁化起义。1928年6月，阮啸仙出席在莫斯科举行的党的第六次全国代表大会，被选为中央审查委员会委员。

1930年，阮啸仙任中共中央北方局委员，河北省委代理书记兼组织部长等职。同年底，阮啸仙被调到上海的中央机关工作。

1933年冬，阮啸仙受党中央派遣来到中央革命根据地。

1934年1月，中华苏维埃共和国第二次全国代表大会在瑞金召开，阮啸仙被选为中央执行委员和中央审计委员会主任，成为我党第一任中央审计委员会主任，是人民审计制度的奠基者。

1935年3月，阮啸仙率领赣南省党政机关向赣粤边方向突围，至江西信丰牛岭一带时，不幸被流弹击中，壮烈牺牲。